Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB6CQ53S08 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6CQ53S08 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms