Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms