Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP28Q4G0W2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP28Q4G0W2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms