Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms