Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC142Q17RM4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC142Q17RM4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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