Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRNQ16849 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRNQ16849 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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