Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP6Q16828 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP6Q16828 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP6Q16828 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP6Q16828 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP6Q16828 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP6Q16828 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP6Q16828 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP6Q16828 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP6Q16828 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP6Q16828 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP6Q16828 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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