Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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SIX1Q15475 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SIX1Q15475 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SIX1Q15475 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SIX1Q15475 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SIX1Q15475 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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