Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SHPRHQ149N8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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