Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3AQ14563 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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