Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM25Q14258 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms