Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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CNGB1Q14028 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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CNGB1Q14028 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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CNGB1Q14028 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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CNGB1Q14028 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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CNGB1Q14028 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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CNGB1Q14028 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB1Q14028 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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