Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK13Q14004 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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