Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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