Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms