Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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