Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RPA4Q13156 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RPA4Q13156 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RPA4Q13156 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPA4Q13156 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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RPA4Q13156 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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RPA4Q13156 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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RPA4Q13156 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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