Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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