Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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GRIK2Q13002 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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