Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXF2Q12947 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms