Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAF2Q12933 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms