Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN2AQ12879 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN2AQ12879 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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