Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SREBF2Q12772 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SREBF2Q12772 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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