Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TGM3Q08188 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms