Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CXCL9Q07325 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms