Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERCC6Q03468 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms