Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms