Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms