Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNC1Q01954 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms