Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TFAMQ00059 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms