Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SIM1P81133 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIM1P81133 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms