Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P62684 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms