Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVFC1P60507 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms