Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LOXL3P58215 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms