Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA2D1P54289 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D1P54289 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms