Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNB3P54284 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB3P54284 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms