Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IDH3AP50213 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IDH3AP50213 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IDH3AP50213 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IDH3AP50213 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms