Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RGRP47804 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RGRP47804 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RGRP47804 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms