Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RECQLP46063 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RECQLP46063 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RECQLP46063 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RECQLP46063 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RECQLP46063 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RECQLP46063 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RECQLP46063 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RECQLP46063 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RECQLP46063 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RECQLP46063 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RECQLP46063 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms