Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTSOP43234 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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