Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NSG1P42857 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NSG1P42857 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NSG1P42857 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms