Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms