Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SPRR1AP35321 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms