Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
BMI1P35226 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
BMI1P35226 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
BMI1P35226 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
BMI1P35226 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
BMI1P35226 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
BMI1P35226 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BMI1P35226 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BMI1P35226 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms