Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD6P30203 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD6P30203 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD6P30203 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms