Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 511 ms