Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBL1P28749 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms