Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LOXP28300 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LOXP28300 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LOXP28300 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LOXP28300 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms