Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR1BP28222 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms