Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms